综合强度层面，调整后的忍者梯队中，长门、四代雷影和秽土三代稳居第一梯队。长门经过技能优化后，普攻流畅度显著提升，二技能阎王防守兼具防御与反击能力，一技能三连炮可灵活用于突进或消耗，配合大招的全屏奥义，攻防一体且容错率高。四代雷影则以莽夫流著称，四豆状态下抓取技能可破霸体，大招后无缝衔接双技能的机制让他在决斗场中压制力极强，尤其适合激进型玩家。秽土三代则凭借忍术教授的设定拥有多达9个技能，通过金刚牢壁控场接火遁的连招能瞬间秒杀对手，是技术流玩家的首选。
操作难度与适用场景是衡量忍者价值的另一维度。宇智波斑和面具男属于上限极高的角色，但需要精准操作。斑的起手能力极强，二技能空中位移覆盖全Y轴，一技能反手反击效果突出，大招范围几乎覆盖全屏；面具男在神威空间中伤害加成显著，二技能位移兼具进攻与逃生功能，适合擅长走位拉扯的玩家。相比之下，初代火影的格挡机制和无限连击普攻对新手更友好，而秽土四代虽操作复杂，但飞雷神机制在高段位仍有一席之地。
版本变迁与养成策略同样影响忍者选择。例如强势的死二代和疾风咒佐因技能范围削弱逐渐退出T0梯队，而新晋的佩恩天道超和须佐能乎佐助凭借多段抓取和无敌帧机制成为ban位常客。对于零氪玩家，建议优先获取高招S忍如秽土鼬或忍战我爱罗；微氪玩家则可选择暴怒带土等点券忍者，反打能力强且养成周期短。
